На основании чего районы России объединяются в макрорегионы?

Ну во-первых, на основании соседского расположения субъектов, входящих в состав этих макрорегионов.

Во-вторых, это то, что в каждом макрорегионе должен быть хотя бы один крупный центр экономического роста, которые есть далеко не в каждом субъекте РФ, из-за чего им нужно объединятся в макрорегионы.