Какие альтернативы развития существовали в середине - второй половине 16 века? что между ними общего ив чём различия? какая модель развития и почему взяла верх?

Для России можно выделить такие альтернативы:

Продолжение деятельности Избранной Рады после 1560 года, именно на ее период пришлись самые успешные годы правления Ивана IV. Отказ от опричнины. Прекращение Ливонской войны до появления в Польше на троне Стефана Батория, это могло привести к вхождению в состав Московского царства, например, Нарвы и Полоцка. Продолжение крымских походов (1558-1561) и постепенная экспансия на юг (строить крепости и засечные черты). Это могло задержать крымского хана в степях и тогда не было бы разорения Москвы в 1571 году. Разгром хана Кучума сразу после его прихода к власти в 1560-ые и начало более раннего освоение Сибири и Урала.

В Европе альтернативы были связаны с выбором направления христианства: католичество, протестантизм, кальвинизм.