Подошел маленький поезд, весь из пустых товарных вагонов. Почему обособляется вторая часть предложения?

Вторая часть предложения в рассматриваемом случае обособляется при написании посредством использования запятой с учетом общепринятых правил русского языка. Обособление обусловлено тем, что по смыслу между частями предложения можно подставить: " ... который состоял ... ", " ... состоящий ... ". Ввиду того, что предложение является неполным, части его необходимо разделять запятой. Вышеуказанное правило применено при написании исходного предложения.