Может быть потому что он не в нашем классе? Нужна запятая и где?

"Может быть, потому что он не в нашем классе."

В данном предложении ставится запятая после словосочетания "может быть", так как оно является вводным словом. Но не всегда это делается - все зависит от контекста. Что бы проверить, ставить ли в той или иной ситуации запятую, нужно на место вводного слова подставить синоним. (Например, "возможно"). Если смысловая цепочка не нарушилась, запятую ставить не нужно.