Почему где не был или где бы я ни был частицы не и ни

В первом случае "где не был" подразумевается отрицание. Поэтому пишется частица "не". Например: "Я не могу знать, что происходит там, где я не был".

Во втором случае "где бы я ни был" нет смысла отрицания, наоборот, утверждение. Поэтому пишется "ни". Это может быть, например, перечисление: "Я был и там, и здесь, но, где бы я ни был, я все равно ... ". Или подчеркивание смысла: "Я сделаю это в любом случае, где бы я ни был".