Какой корень у слова вынуть?

Единственное слово русского языка, не имеющее на поверхностном уровне корня, - вынуть. Считается, что в этом слове так называемый нулевой корень, находящийся в чередовании с корнем - им - (вын-им-ать). Раньше, примерно до XVII века, этот глагол выглядел как вынять, и в нём был материальный корень, такой же как в снять, обнять, понять (ср. снимать, обнимать, понимать), однако впоследствии корень - ня - был переосмыслен как суффикс - ну - (как в сунуть, дунуть).