Какая грамматическая основа в данном предложении "В хрустальной вазе стоят свежие цветы

Грамматическая основа - это подлежащее + сказуемое. Основная мысль предложения заложена в его грамматическую основу.

(Что?) цветы - подлежащее (имя существительное).

Цветы (Что делают?) стоят - сказуемое (глагол).

Стоят (Где?) в вазе - обстоятельство (имя существительное).

Вазе (Какой?) хрустальной - определение (имя прилагательное).

Грамматическая основа - цветы стоят.

Это двусоставное предложение, так как присутствуют сказуемое и подлежащее.