Сын приехал из города к отцу в деревню. В деревню какой падеж.

Чтобы определить падеж данного существительного, зададим к нему вопрос от главного слова.

Приехал (во что?) в деревню.

На вопрос "что?" отвечают существительные в именительном и винительном падеже. Только, во-первых, при именительном падеже предлогов не бывает, а во-вторых, окончание - ю есть у существительных в винительном, но не именительном падеже.

Поэтому "в деревню" - винительного падежа.