Почему кукушкин лён и сфагнум относятся к высшим мхам?

К высшим растениям относят те, у которых есть четкое разделение на органы с четко выраженными функциями. Низшие же растения не обладают этим свойством (водоросли лишайники). Кукушкин лён и сфагнум относятся к мхам, а значит и к высшим растениям.

С начало надо определить: что такое высшее растение, а что низшее?

Низшие это водоросли, а высшие растения - все остальные.

Кукушкин лен - это не водоросль, хотя и живет в местах, отличающихся повышенной влажностью. Это - мох.

А Сфагнум это тоже мох, а не водоросль, поэтому высшее растение.