Для селекции микроорганизмов наиболее часто используются методы: 1) искусственного 2) искусственной полиплодизации 3) близкородственных скрещиваний мутагенеза 4) межвидовой гибридизации

Селекция микроорганизмов - это очень сложный процесс. Если проводить селекцию животных или растений - это процесс довольно простой, то без наличия специального оборудования и питательной среды проводить селекционные работы с микроорганизмами невозможно. Используют для этого метод искусственного отбора. Штаммы микроорганизмов в основном создают в лабораториях фармацевтических компаний, на различных производствах и прочих предприятиях. Могут выводить штаммы бактерий, одноклеточных грибов и других организмов для полезных целей.