Он давно хотел кораблик, мечтал, как будет пускать его в заливе. Сколько грамматичнских основ?

(Кто?) он - подлежащее (местоимение).

Он (Что делал?) хотел, мечтал - однородные сказуемые (глаголы).

Хотел (Как?) давно - обстоятельство (наречие).

Хотел (Что?) кораблик - дополнение (имя существительное).

Подлежащего нет во второй части предложения.

(Что будет делать?) будет пускать - сказуемое (глагол).

Будет пускать (Кого?) его - дополнение (местоимение).

Будет пускать (Где?) в заливе - обстоятельство (имя существительное).

В предложении две грамматические основы: он хотел, мечтал и будет пускать.