Как правильно?; еду в троллейбусе или на троллейбусе?

Правильно - "в троллейбусе", так как подразумевается нахождение непосредственно в транспорте, внутри него. В таком случае используется только предлог "в", выражающий ограниченность в пространстве. "На троллейбусе" уместно говорить и писать, если имеется в виду нахождение на крыше троллейбуса, на нем.