Вариант с частицей не: А) (не) большая, а ценная посылка. В) (не) глубокая, но рыбная речка. С) (не) красивый, но чем-то привлекательный человек. Д) (не) близкое, а далекое село. Е) (не) большой, но очень чистый городок.

В варианте Д "не" является частицей и пишется с прилагательным раздельно. В этом случае имеется противопоставление, и признаки являются противоположными. В остальных случаях "не" является приставкой, так как при имеющемся противопоставлении признаки не являются взаимоисключающими.

А) небольшая, а ценная посылка;

Б) неглубокая, а рыбная речка;

С) некрасивый, но чем-то привлекательный человек;

Д) не близкое, а далекое село;

Е) небольшой, но очень чистый городок.