Вместо многоточия вставьте словосочетания. Это было ..., нежели обычный каприз. Ничто иное Ни что иное Нечто иное Не что иное Что не иное

Это было нечто иное, нежели обычный каприз - правильный вариант.

Это утвердительное предложение с противопоставлением: это было что-то другое, а не каприз. Местоимение "нечто" в данном случае - неопределенное, а "не" - ударная приставка, которая пишется с местоимением слитно.