Нужно ли ставить запятую между союзами (и - если) в предложении: Мать не хотела отпускать сына, когда он собирался в командировку и если бы не наказ отца, она бы всю жизнь держала его около себя.

Правильная постановка знаков в данном предложении:

(1) Мать не хотела отпускать сына, (2) когда он собирался в командировку, (3) и, (4) если бы не наказ отца, (3) она бы всю жизнь держала его около себя.

Запятая перед И - отделяет части 1 и 3 сложного предложения. Запятая после И - отделяет части 3 и 4 сложного предложения.

Запятая нужна, так как в предложении несколько грамматических основ.